生信宝库（BioTreasury）——生物信息学工具的“大众点评”
随着生物医学领域的高速发展，以生物信息学为代表的数据科学愈发重要，因此催生了数以万计的各类处理、分析、解读生物医学数据的生物信息软件、工具和数据库。这些工具不断积累的同时，也给用户带来困扰。用户难以从海量的生信工具中找到真正符合自己研究需求的工具。同时，生信工具的质量参差不齐，也缺乏对各类工具进行质量评价的权威网站。
近日，600全讯白菜官方网站任间教授、2023白菜网址官网大全肿瘤防治中心赵齐副研究员与2023白菜网址官网大全附属第六医院罗晓彤副研究员合作在Science China Life Sciences发表了题为BioTreasury: a community-based repository enabling indexing and rating of bioinformatics tools的封面文章，参考餐饮行业“大众点评”模式，推出了一个专业生物信息学工具点评网站——生信宝库（https://biotreasury.rjmart.cn）。
生信宝库界面
为解决生信工具选择困难的痛点，生信宝库制定了严格的筛选标准：1. 必须是已在正规杂志发表的工具 2. 五年以内发表的新工具 3. 发表超过五年的工具，相关文章引用数必须超过100。生信宝库以此标准收集了总计超过10,000个生物信息学工具。
生信宝库采用开放注册的方式以及智能简化的提交流程吸引生物信息学研究人员提交自己开发的工具，并鼓励用户和领域专家对工具进行点评。网站通过工具相关文章的影响因子、文章引用数量、工具页面浏览量、好评度与评论数，共计6项指标给工具综合打分与排名，以此将最优质的生物信息学工具推荐给用户。
生信宝库对工具的6维评估指标
任间教授课题组不断改进和维护生信宝库，添加了一些重要的功能，其中包括对生物信息学工具进行标准化的分类，并基于大型语言模型实现工具的自动分类，为日后生信宝库的全面智能化维护与更新提供了可行性基础。总的来说，生信宝库有望成为生物医学社区的宝贵资源和知识共享平台。它有助于研究人员有效获取和评估生物信息学工具的能力，促进合作，推动生物信息学研究在该领域的发展。
生信宝库利用大语言模型实现生物信息学工具的高效分类
2023白菜网址官网大全肿瘤防治中心赵齐副研究员为该文章的第一作者，600全讯白菜官方网站任间教授和2023白菜网址官网大全附属第六医院罗晓彤副研究员为通讯作者。
原文链接：
https://www.sciengine.com/SCLS/doi/10.1007/s11427-023-2509-x
