白菜官网李文均教授课题组在荒漠特殊生境微生物暗物质研究领域取得重要进展

      荒漠约占全球陆地总面积的1/3，是地球上面积最大、研究最不充分的生境之一，同时也是地球微生物多样性的重要宝库。对荒漠生态系统的微生物多样性、组成和功能进行剖析，将有助于了解旱地生命带来的全球变化、威胁与机遇。作为荒漠生境的一种典型代表类型，沙漠栖息地中许多不同的微生物可产生一系列新的生物活性化合物，包括抗菌、消炎、抗肿瘤及群体感应抑制等诸多方面。然而，由于生态位特化性强、样品采集困难以及传统培养方法适应性有限等因素，绝大多数沙漠微生物被忽视了在实验室条件下的培养与分类鉴定。这一大部分尚未得到充分探索的微生物多样性，代表了巨大的未开发、未表征的微生物资源，俗称“微生物暗物质”，其从根本上阻碍了微生物生态学的发展和生物资源的开发利用。

        尽管基于直接宏基因组学测序（如16S rRNA扩增子、鸟枪法测序）或培养组学（Culturomics）的微生物组学研究不断取得令人振奋的重要发现，但这两种技术目前仍存在诸多局限性。例如，直接宏基因组测序数据的实用性与群落的复杂度和生物量、测序技术和参考数据库等高度相关，这些均可能会导致群落中大量低丰度细菌类群或一些特定类群被忽略；而培养组学通常被认为是劳动密集型的，其可能会遗漏群落中的一些重要特定类群，且难以获取全面的菌株数据集信息。有研究表明，选择性培养富集以降低群落复杂性的策略可能有助于特定环境中微生物群落的宏基因组学研究。然而，在此之前，尚未有结合培养组学和培养富集宏基因组测序两种方法对沙漠微生物组进行挖掘的研究报道。