陈月琴教授/王文涛副教授团队揭示snoRNA的非经典功能

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一直以来,snoRNA被认为是一类具有相似结构和功能的非编码RNA,根据其特有序列特征分为C/D box  H/ACA box两类。正如其名字所提示,传统观点认为snoRNA位于核仁中,通过碱基配对方式主要介导靶向核糖体RNArRNA)修饰。然而,一类称为orphan snoRNA的小核仁RNA并无可预测靶向rRNA,人们对这些snoRNA在细胞内发挥的功能知之甚少。

该团队早期通过对髓系细胞分离亚组分进行snoRNA组芯片筛选鉴定发现,一类snoRNA可富集于染色质上,称为染色质相关snoRNA。其中,部分染色质相关orphan snoRNA可响应DNA损伤压力表现出染色质富集程度的改变,提示此类snoRNA可能参与染色质相关功能。课题组以SNORA73为例发现了orphan snoRNA参与DNA损伤通路的新功能。研究表明该SNORA73在急性髓系白血病病人中特异性低表达,并且发现低表达的SNORA73显著抑制DNA损伤和恶性髓系细胞分化潜能。机制研究显示SNORA73 5’末端非经典结构结合染色质蛋白PARP1和经典蛋白DKC1/NHP2并通过调控其PAR修饰参与DNA损伤通路,揭示了orphan snoRNA介导的DNA损伤修复调控血液肿瘤发生发展中的重要作用。该项研究成果今年早些时候发表在Cell Reports杂志上。600全讯白菜官方网站韩才博士、孙林玉博士、2023白菜网址官网大全附属第一医院罗学群教授为本文共同第一作者。陈月琴教授和王文涛副教授为共同通讯作者。

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SNORA73调控PARP1介导的DNA损伤修复

团队还发现并鉴定一类在该疾病中特异性高表达、并且具有特殊结构的新型的snoRNA-related lncRNA。与之前发现的lncRNA不同,这类lncRNA是一种全新结构的snoRNA-related lncRNA,其由5’m7G帽子和3’snoRNA结构组成,中间和尾部分别含有两个C/D boxsnoRNA:SNORD49ASNORD49B, 并将其命名为LNC-SNO49AB。功能研究显示,LNC-SNO49AB在白血病中高表达,靶向LNC-SNO49AB可以抑制白血病的疾病进程。机制分析显示,LNC-SNO49AB并不参与经典snoRNA介导的2’-O甲基化调控。有趣的是, LNC-SNO49AB可以直接和RNA A-to-I编辑酶ADAR1互作,通过调控ADAR1的二聚化介导其RNA编辑酶活性,进而调控下游包括细胞周期在内的多条通路,影响白血病疾病进程(作用模式图如下)。这些成果提示snoRNA在细胞内还存在未揭示的多样化功能,可能以各种新式参与到除经典rRNA修饰外更多的途径中去。

研究结果近日在Cell discovery杂志正式发表。600全讯白菜官方网站的博士后黄蔚(现为东南大学副研究员)和特聘副研究员孙雨蒙为共同第一作者。陈月琴教授和王文涛副教授为共同通讯作者。生科院张锐教授和宋玉龙研究员在A-to-I测序分析中提供了诸多帮助和指导。相关工作得到了国家重点研发计划、国家自然基金,广东省特支计划杰出人才基金,博士后基金面上项目的支持。

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LNC-SNO49AB调控RNA A-to-I编辑模型图

论文链接:

1.https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S2211124722001450?via%3Dihub

2.https://www.nature.com/articles/s41421-022-00460-9

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