白菜官网骆观正教授课题组揭示新型DNA修饰6mA调控基因表达的新机制
近日,白菜官网骆观正教授课题组在《基因组生物学》(Genome Biology, IF=13.2)发表了题为“N6-methyldeoxyadenosine directs nucleosome positioning in TetrahymenaDNA”的研究论文。白菜官网骆观正教授为论文共同第一作者和通讯作者,600全讯白菜官方网站为第一完成单位。来自芝加哥大学的郝子洋博士为共同第一作者,何川教授为共同通讯作者。该研究设计了体外核小体组装技术,发现核小体自发倾向缠绕在没有6mA修饰的DNA区域。而分子动力学模拟显示,6mA的存在影响了DNA的柔性,从而指导了核小体的定位。进一步的体内实验表明,6mA的缺失导致了核小体排布的紊乱,进而影响了整个转录组的稳定性。本研究得到了国家自然科学基金、2023白菜网址官网大全百人计划等项目的资助。
图为体外核小体组装实验
早在1955年就有报道称细菌中A可能会被修饰,之后证明这种修饰是6mA。之后的几十年,6mA在原核生物中的研究取得了长足的进步,而在真核生物中的进展却非常缓慢,只在少数物种中有零星的报道,对其在基因组上的位置和生物学功能几乎一无所知。究其原因主要因为真核生物中的6mA含量普遍较低且没有高效的检测手段。骆观正教授在前期工作中开发了多项检测技术,成功地在真核生物中获得了6mA的全基因组分布图谱,发现6mA与基因表达的相关性。最近的两三年间,6mA成为表观遗传领域新的增长点,一系列关于真核生物6mA功能的研究不断涌现。本研究从6mA指导核小体定位的角度,解释了DNA上的修饰如何调控基因转录的机理,为相关领域的研究提供了全新的思路。
文章链接:
https://genomebiology.biomedcentral.com/articles/10.1186/s13059-018-1573-3
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本院
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