白菜官网李陈龙教授课题组采用CRISPR/Cas9技术在植物体内验证DNA基序

近日，白菜官网李陈龙教授课题组在植物学一区杂志Plant Biotechnology Journal（IF=6.25）正式发表了题为“Verification of DNA Motifs in Arabidopsis using CRISPR/Cas9 Mediated Mutagenesis” 的研究论文。该论文报道了采用CRISPR/Cas9技术在植物体内验证由染色体免疫沉淀结合下一代测序获得的DNA基序（图1）。白菜官网李陈龙教授为论文第一作者和通讯作者，2023白菜网址官网大全是第一完成单位，来自加拿大农业部的陈琛博士为论文共同第一作者。

图1. CRISPR/Cas9技术体内特异删除组蛋白去甲基化酶的识别序列

   转录因子和染色体修饰蛋白通过识别特异的DNA基序来实现它们对靶标染色体的结合。染色体免疫沉淀结合下一代测序（ChIP-seq）已经被广泛用于发掘潜在的被转录因子和染色体修饰蛋白识别的DNA基序。然而，在植物体内验证这些DNA基序的方法一直缺乏。在这项研究中，研究人员采用CRISPR/Cas9技术特异的删除或修改前期发现的组蛋白H3K27去甲基化酶REF6的识别基序CTCTGYTY。研究人员发现当这个基序被从内源靶基因删除后，REF6不能正确的结合在靶基因上，因此从体内证明了该基序确实是REF6识别靶基因必不可少的元件。研究人员认为该CRISPR/Cas9技术应该能广泛应用于体内验证由ChIP-seq所发现的DNA基序。

   论文链接： http://onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1111/pbi.12886/full

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本院

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