白菜官网张锐教授团队在miRNA表观遗传领域取得新进展
近日,国际学术权威期刊Genome Research(五年影响因子14.4)在线发表了白菜官网张锐教授团队题为“The landscape of miRNA editing in animals andits impact on miRNA biogenesis and targeting”的研究论文。该研究通过自主开发的miR-mmPCR-seq测序技术揭示了miRNA编辑现象的广泛性,为miRNA生物学研究开辟了新的研究方向。这一技术也为今后低成本和超高通量的研究miRNA 编辑在免疫疾病和肿瘤发生发展中的作用打下了坚实的技术基础。白菜官网博士生李丽诗和特聘副研究员宋玉龙为该论文的共同第一作者,张锐教授为最后通讯作者,2023白菜网址官网大全为唯一单位。
A-to-IRNA编辑是哺乳动物转录组中分布最广泛的一种修饰类型,在先天免疫系统和肿瘤发生发展中起着重要的作用。脱氨催化酶ADAR通过结合蛋白编码基因或非编码序列的双链RNA区域介导这一编辑修饰。张锐等人2014年在顶级学术期刊Nature Methods上首次报道了针对蛋白编码基因的靶向RNA测序技术mmPCR-seq,并将这一技术应用于国际基因型与组织表达计划,其研究成果以共同作者方式发表于一系列高影响力学术期刊(Science (2015), Nature Genetics (2015), GenomeResearch (2015), Nature (2017)),在基因组层面揭示了调控变异对基因表达所产生的影响。
带有茎环结构的miRNA前体是ADAR的天然底物。然而,miRNA的前体具有快速加工、相对表达量低等特点,使得系统性研究miRNA上的RNA编辑具有极大的技术难度。在这篇论文中,张锐教授团队开发了靶向miRNA测序技术(miR-mmPCR-seq)用于精确定量miRNA前体RNA编辑水平。通过这一技术首次实现在全转录组前体miRNA的捕获。该研究揭示80%的前体miRNA都能发生RNA 编辑,并且RNA 编辑调控miRNA的加工、链选择以及靶基因识别。该研究还发现miRNA编辑可能参与神经功能和人类特异的非神经类组织器官发育的调控机制。
张锐教授,2015年起入职白菜官网,“珠江人才计划”创新创业团队成员。张锐长期从事RNA表观遗传组学、生物信息学和高通量测序技术开发方面的研究。目前主持包括“国家自然科学基金”面上和重大研究计划、“广东省重大科技专项(前沿与关键技术创新方向)”等项目。
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